La strumentazione di ultima generazione (IDEXX) permette di effettuare indagini su qualsiasi tipo di campione biologico a favore di qualsiasi specie animale. Il laboratorio è un' unità separata dal resto della struttura, così da impedire ogni tipo di contaminazione e garantire una qualità di esami di alto livello. 

Il laboratorio interno della San Pio Clinica Veterinaria effettua una vasta gamma di esami: 

Le analisi vengono svolte in tempo reale in struttura permettendo di avere gli esiti entro le 24h tutti i giorni dell'anno, sia in regime notturno che diurno, sia festivo che feriale consentendo ai medici la tempestività necessaria per effettuare le diagnosi più accurate e sopratutto nelle situazioni di emergenza per offrire ai propri pazienti le soluzioni mediche o chirurgiche più indicate ed efficaci. Questo laboratorio per la sua completezza strumentale e per l'accurata preparazione scientifica del suo staff rappresenta un'unicità nell'area settentrionale della bassa modenese.